口袋妖怪心金版与口袋妖怪魂银版是金银版在任天堂DS上的重制游戏。游戏最初在日本于2009年9月12日发售，北美、澳洲和欧洲则于2010年3月发售。

游戏总监森本茂树在尊重前作玩家的感受的同时，力求保证作品的时代感。游戏的社会反响将为积极，两个版本成为了Metacritic有史以来得分最高的DS游戏。截至2014年3月，游戏销售总量达到1272万，成为最热销的任天堂DS游戏之一。

和火红叶绿版发生在关都地方对应，心金魂银版的故事发生在城都地方，主角从若叶镇开始冒险。虽然游戏有了很多的新特性，但主线剧情依然与金银版类似，一些原来在水晶版独有的要素也加入到了心金魂银版中。就像火红叶绿版可以与红蓝绿宝石版通讯交换，心金魂银版也可以和钻石珍珠白金版通讯交换，来获得城都和关都地方不存在的神奇宝贝，比如草苗龟、小火焰猴与波加曼。

虽然水晶版已经加入了女主角，但心金魂银版中女主角更换为琴音。无论玩家选择男主角还是女主角，另一性别的主角都会作为游戏中的登场人物，就像红蓝绿宝石版、钻石珍珠白金版一样。

尽管是《金・银》的重制版本，游戏同样加入了《水晶》的剧情元素。在三圣兽中，游戏突出了水君同主角的多次邂逅并增设了通关后的对战开拓区。（《水晶》中仅有战斗塔可用）此外，城都和关都也加入了第四时代的特色地点朋友公园。